De Female Titan heeft een unieke combinatie van vermogens die haar tot een van de meest veelzijdige Titans maakt. Haar snelheid en behendigheid overtreffen die van de meeste andere Titans, wat haar bijzonder gevaarlijk maakt in open terrein.
Haar eerste unieke vermogen: via een specifieke schreeuw kan ze pure Titans aantrekken die haar dan aanvallen of verdedigen. Annie gebruikte dit strategisch tijdens de 57e expeditie om de Scout Regiment-formatie te verwarren en Titans als wapen in te zetten. Erwin begreep dit en lokte haar bewust een val in.
Haar tweede vermogen: selectieve of volledige kristallisatie van haar lichaam. Ze kan bepaalde lichaamsdelen verharden voor aanval of verdediging, maar ook haar hele lichaam inkristalliseren voor absolute bescherming. Na haar ontmaskering in Stohess gebruikte Annie dit om een cocon te vormen waaruit niemand haar kon bevrijden.
Jaren later in seizoen 4 wordt de cocon geopend door een speciale vloeistof. Annie ontwaakt in een wereld die ze niet meer herkent. Haar Titan-vermogens zijn nog intact, en in de finale slag draagt ze bij aan de strijd tegen Eren — deels uit pragmatisme, deels uit onvoltooide belofte aan haar vader.